R語言醫學數據分析實踐 李丹 宋立桓 蔡偉祺 9787302673484 【台灣高等教育出版社】

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原出版社:清華大學
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書名:R語言醫學數據分析實踐
ISBN:9787302673484
出版社:清華大學
著編譯者:李丹 宋立桓 蔡偉祺
叢書名:大數據技術叢書
頁數:279
所在地:中國大陸 *此為代購商品
書號:1685274
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內容簡介

本書以易於初學者理解為原則,強調實戰和應用,結合大量精選的實例對常用的R語言數據分析方法進行了深入淺出的介紹,以幫助讀者解決數據分析中的實際問題。 本書以通俗易懂的方式詳細介紹R語言的基礎知識和公共醫學資料庫挖掘,同時通過實際操作引導讀者入門醫學科研論文中的數據分析。

作者簡介

宋立桓,IT資深技術專家、佈道師,主要負責為企業客戶提供顧問諮詢、培訓和方案設計服務。目前是騰訊雲架構師專註于雲計算、大數據和人工智慧,對區塊鏈的相關技術也有深入的研究。著有圖書《Cloudera Hadoop大數據平台實戰指南》和《AI制勝:機器學習極簡入門》。

目錄

第1章 R語言介紹
1 1 R語言概述
1 1 1 什麼是R語言
1 1 2 臨床醫生使用R語言的優勢
1 2 R編程環境的搭建
1 2 1 R語言的下載和安裝
1 2 2 RStudio的下載和安裝
1 2 3 RStudio操作
1 3 R語言包
1 3 1 什麼是R包
1 3 2 R包的安裝
1 4 初識R語言的注意事項
第2章 R語言的基本語法
2 1 R語言的數據結構
2 1 1 向量
2 1 2 矩陣
2 1 3 數組
2 1 4 數據框
2 2 R語言函數簡介
2 2 1 函數的定義
2 2 2 常用內置函數的使用
2 3 R語言中的數據讀寫
2 3 1 讀取文件
2 3 2 寫入文件
2 3 3 讀寫其他數據文件
2 4 R語言流程式控制制
2 4 1 判斷語句
2 4 2 循環語句
2 5 字元串操作
2 6 R語言數據保存
第3章 R語言數據清洗
3 1 數據清洗的重要性
3 2 數據質量評估
3 3 數據清洗
3 3 1 缺失值檢查及處理
3 3 2 異常值檢查及處理
3 3 3 重複值檢查及處理
3 4 數據清洗dplyr包的使用
3 5 數據清洗實戰
第4章 R語言數據可視化
4 1 基礎繪圖
4 2 ggplot2繪圖
4 2 1 ggplot2語法入門及相關軟體包
4 2 2 ggplot2繪製簡單的統計圖形
4 2 3 ggplot2繪製複雜圖形(統計圖的組合、分面展示)
4 3 高質量SCI論文繪圖
4 3 1 聚類分析和相關分析的熱圖詳解
4 3 2 ROC曲線的繪製
4 3 3 火山圖的繪製
第5章 R語言統計建模分析
5 1 經典統計分析
5 1 1 t檢驗
5 1 2 方差分析
5 1 3 卡方檢驗
5 1 4 簡單線性回歸分析
5 2 高級回歸分析
5 2 1 多重線性回歸分析
5 2 2 Logistic回歸分析
5 2 3 回歸分析實戰
5 3 SCI文章兩表一圖實戰
5 3 1 SCI文章—基線資料表
5 3 2 SCI文章—單因素回歸分析表或多因素回歸分析表
5 3 3 SCI文章—亞組分析的森林圖
5 3 4 限制性立方樣條圖
第6章 R語言機器學習實戰入門
6 1 什麼是機器學習
6 2 機器學習的流程
6 2 1 數據收集
6 2 2 數據預處理
6 2 3 特徵工程
6 2 4 模型構建和訓練
6 3 機器學習分類
6 3 1 監督學習
6 3 2 無監督學習
6 3 3 強化學習
6 4 過擬合和欠擬合
6 4 1 過擬合
6 4 2 欠擬合
6 5 衡量機器學習模型的指標
6 5 1 正確率、精確率和召回率
6 5 2 幾個常見的比率
6 5 3 混淆矩陣
6 5 4 F1score和ROC曲線
6 6 K折交叉驗證
6 7 支持向量機概述
6 8 隨機森林概述
6 9 糖尿病風險預測實戰
6 9 1 數據集背景
6 9 2 數據預處理
6 9 3 模型建立
6 9 4 模型評估
6 10 ICU患者死亡率預測實戰
6 10 1 數據集背景
6 10 2 數據預處理
6 10 3 模型建立
6 10 4 模型評估
第7章 列線圖在預測模型中的應用
7 1 列線圖基本原理
7 2 列線圖的三大要素
7 3 列線圖解讀
7 4 列線圖的實戰
7 4 1 列線圖R實例一
7 4 2 列線圖R實例二
7 5 列線圖在數據挖掘中的應用
第8章 臨床數據挖掘中的生存分析
8 1 基本概念和原理
8 1 1 什麼是生存數據
8 1 2 生存分析的含義
8 1 3 為什麼要用生存分析
8 1 4 生存分析的刪失
8 1 5 生存分析的常用方法
8 2 Kaplan-Meier法生存分析實戰
8 2 1 Kaplan-Meier法介紹
8 2 2 Kaplan-Meier生存曲線R語言實戰
8 3 Cox生存分析實戰
8 3 1 Cox回歸模型介紹
8 3 2 Cox回歸模型實戰
8 4 競爭風險模型
8 4 1 臨床研究中如何處理競爭事件
8 4 2 競爭風險模型R語言實戰
第9章 NHANES資料庫挖掘實戰
9 1 NHANES資料庫介紹
9 2 NHANES資料庫的下載與合併
9 3 NHANES權重介紹及使用
9 3 1 什麼是權重
9 3 2 NHANES權重分析的必要性
9 3 3 NHANES權重如何選擇
9 3 4 NHANES權重實戰
9 4 NHANES數據分析實戰
9 5 NHANES資料庫發文選題介紹
第10章 GEO資料庫挖掘實戰
10 1 GEO資料庫介紹
10 1 1 GEO資料庫概況
10 1 2 GEO資料庫組織結構
10 2 GEO資料庫檢索
10 3 晶元基礎知識
10 4 GEO資料庫分析實戰
10 4 1 找GSE編號
10 4 2 安裝生物信息分析所需的R包
10 4 3 下載表達矩陣
10 4 4 獲取分組信息
10 4 5 獲取表達矩陣並檢查數據
10 4 6 轉換探針ID
10 4 7 差異分析
10 4 8 分析結果可視化—火山圖、熱圖
10 5 GEO多數據集差異分析
第11章 孟德爾隨機化分析實戰
11 1 什麼是孟德爾隨機化
11 1 1 基因型和表型
11 1 2 孟德爾隨機化簡介
11 2 孟德爾隨機化研究流程
11 2 1 MR研究
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