生物計算 許進 9787115665799 【台灣高等教育出版社】

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書名：生物計算
ISBN：9787115665799
出版社：人民郵電
著編譯者：許進
頁數：356
所在地：中國大陸 *此為代購商品
書號：1732455
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內容簡介

生物計算是一種以DNA、RNA和蛋白質等生物大分子為數據的計算。本書較為深入地探討DNA計算的各個方面，從基礎理論到實驗操作，再到解的檢測，都囊括其中。同時，書中對RNA計算和蛋白質計算也進行了概述。全書共12章。其中，第1章～第4章詳細介紹圖與計算複雜性、生物計算數據、生物計算運算元（酶與生化操作），以及在DNA計算中發揮關鍵作用的技術和方法。第5章重點闡述DNA編碼理論與算法。第6章～第8章深入探討枚舉型、非枚舉型、并行型等多種DNA計算模型的構建思路和優缺點。第9章與第10章介紹一些DNA計算在密碼學、生物信息學、優化問題等領域的應用案例。第11章與第12章介紹RNA計算與蛋白質計算的相關理論與應用。這樣的結構安排旨在為讀者提供一個全面、系統的生物計算知識框架。 本書適合圖論與算法、分子生物學、計算機科學、生物信息學及人工智能等領域的科研人員、高等學校師生，以及對生物計算感興趣的讀者閱讀。

目錄

第1章 緒論
1 1 生物計算的產生
1 2 計算機的一般定義與計算模型
1 3 生物計算的研究意義與進展
參考文獻
第2章 圖與計算複雜性
2 1 圖論基礎
2 1 1 圖的定義與類型
2 1 2 圖的度序列
2 1 3 圖的運算
2 1 4 圖的同構
2 1 5 圖的矩陣
2 1 6 圖著色
2 2 圖靈機
2 2 1 圖靈機的起源
2 2 2 圖靈機的原理、類型及圖靈等價性
2 3 可計算性
2 4 計算複雜性
2 4 1 P問題與NP問題
2 4 2 coNP問題
參考文獻
第3章 生物計算數據：DNA、RNA與蛋白質
3 1 DNA分子
3 1 1 脫氧核苷酸
3 1 2 DNA分子結構
3 1 3 DNA分子類型
3 1 4 DNA分子特性
3 1 5 DNA生化反應
3 2 RNA分子
3 2 1 RNA分子的核苷酸
3 2 2 RNA分子的結構
3 2 3 RNA分子的類型
3 3 蛋白質分子
3 3 1 蛋白質的結構
3 3 2 蛋白質的類型
3 3 3 蛋白質計算輸出檢測技術
參考文獻
第4章 生物計算運算元：酶與生化操作
4 1 生物計算常用工具酶
4 1 1 限制性內切核酸酶
4 1 2 DNA聚合酶
4 1 3 DNA連接酶
4 1 4 DNA修飾酶
4 1 5 核酸酶
4 2 生物計算的生化操作
4 2 1 DNA分子的合成
4 2 2 DNA分子的切割、連接及粘貼
4 2 3 DNA重組技術
4 2 4 變性與雜交
4 2 5 DNA分子的擴增
4 2 6 DNA分子的分離與提取
4 2 7 DNA分子的檢測與讀取
4 2 8 可用於生物計算的經典生化操作技術
4 2 9 可用於生物計算的新型生化操作技術
4 2 10 生物計算涉及的新型儀器
4 3 生物計算的關鍵技術：電泳
4 3 1 基本原理
4 3 2 凝膠電泳
4 3 3 免疫電泳
4 3 4 毛細管電泳
4 3 5 介電電泳
4 3 6 等速電泳
4 4 生物計算的關鍵技術：聚合酶鏈反應
4 4 1 PCR發明之旅
4 4 2 基本原理
參考文獻
第5章 DNA編碼理論與算法
5 1 DNA編碼的背景與發展
5 2 DNA編碼問題
5 2 1 DNA編碼的常見約束
5 2 2 編碼問題及其數學模型
5 2 3 當前DNA編碼算法分類
5 3 基於GC含量的DNA編碼計數理論
5 3 1 DNA編碼計數理論
5 3 2 GC含量相等的DNA編碼設計
5 4 模板編碼理論與算法
5 4 1 模板編碼理論
5 4 2 模板編碼的搜索算法
5 4 3 編碼的熱力學穩定性
5 4 4 模板集的優化
5 5 進化多目標優化DNA編碼理論與算法
5 5 1 進化多目標優化DNA編碼理論
5 5 2 基於進化多目標優化的DNA編碼算法框架
5 6 隱枚舉編碼理論與算法
5 6 1 隱枚舉編碼理論
5 6 2 隱枚舉算法的應用
參考文獻
第6章 枚舉型DNA計算模型
6 1 有向哈密頓路徑問題的DNA計算模型
6 2 可滿足性問題的DNA計算模型
6 3 圖的最大團與最大獨立集問題的DNA計算模型
6 4 0-1規劃問題的DNA計算模型
6 5 圖頂點著色問題的DNA計算模型
參考文獻
第7章 非枚舉型圖頂點著色DNA計算模型
7 1 基本思想
7 2 生物實現
7 2 1 生物操作步驟
7 2 2 實例分析與相關生化實驗
7 3 計算模型分析
7 4 其他非枚舉型DNA計算模型
參考文獻
第8章 并行型圖頂點著色DNA計算模型
8 1 模型與算法
8 1 1 子圖劃分與橋點的確定
8 1 2 子圖頂點排序與子圖中每個頂點顏色集的確定
8 1 3 DNA序列的編碼
8 1 4 根據探針圖確定探針
8 1 5 初始解空間的合成
8 1 6 非解刪除
8 1 7 子圖逐級合併與非解刪除
8 1 8 解的檢測
8 2 具體算例
8 2 1 子圖劃分與顏色集確定
8 2 2 編碼
8 2 3 構建初始解空間
8 2 4 子圖刪除非解
8 2 5 子圖合併與非解刪除
8 3 複雜性分析
8 3 1 降低初始解空間的複雜性
8 3 2 提高并行性
參考文獻
第9章 探針機
9 1 探針機的產生背景
9 2 探針機的原理
9 2 1 圖靈機機理分析
9 2 2 探針機的數學模型
9 3 探針機求解哈密頓問題
9 4 連接型探針機的一種實現技術
9 5 傳遞型探針機與生物神經網絡
9 6 探針機功能分析
9 6 1 圖靈機是探針機的一種特殊情況
9 6 2 圖靈機能否模擬探針機
9 6 3 探針機的優勢
參考文獻
第10章 DNA算法自組裝
10 1 DNA Tile計算
10 1 1 DNA Tile類型
10 1 2 DNA Tile計算實例
10 2 圖靈等價的DNA Tile計算
10 2 1 DNA Tile計算的數學模型
10 2 2 DNA Tile計算的圖靈等價性
10 3 可編程DNA Tile結構
10 4 單鏈DNA Tile計算
10 5 基於SST的通用DNA計算
10 5 1 基於SST的迭代布爾電路計算模型
10 5 2 基於可重複SST的填充計算模型
10 6 DNA Origami計算
10 6
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