微生物擴增子高通量測序數據分析 許繼飛 9787122435286 【台灣高等教育出版社】
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物品所在地：中國大陸
原出版社：化學工業
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| *完成訂單後正常情形下約兩周可抵台。 *本賣場提供之資訊僅供參考，以到貨標的為正確資訊。 印行年月：202309*若逾兩年請先於私訊洽詢存貨情況，謝謝。 台灣(台北市)在地出版社，每筆交易均開具統一發票，祝您中獎最高1000萬元。 書名：微生物擴增子高通量測序數據分析 ISBN：9787122435286 出版社：化學工業 著編譯者：許繼飛 頁數：208 所在地：中國大陸 *此為代購商品 書號：1557103 可大量預訂，請先連絡。 內容簡介 本書重點介紹了微生物擴增子高通量測序數據格式和數據質控、擴增子高通量數據分析方法、微生物多樣性分析、微生物群落結構及差異分析、基因功能預測、微生物與環境因子關聯分析及相關可視化等內容，兼具分析理論和方法實操。從實驗設計、質量控制、數據分析到可視化圖表，由淺入深，循序漸進，為廣大讀者提供了一本系統的擴增子高通量測序數據分析的實戰工具書。 本書適合廣大生物信息學、生物技術、生態、環境、食品、醫學等相關領域的科研人員和相關專業師生閱讀參考。目錄 第1章 測序數據1 1 示例數據 1 1 1 分析目標 1 1 2 採樣點概況 1 1 3 理化數據 1 1 4 擴增子高通量測序數據 1 2 文件類型 1 3 文件內容 1 3 1 FASTQ存儲格式特點 1 3 2 鹼基質量 1 4 質量評估 1 4 1 評估方法 1 4 2 分析結果 1 4 3 總體樣本質量 第2章 擴增子高通量數據分析 2 1 分析平台 2 1 1 平台介紹 2 1 2 平台搭建 2 1 3 Ubuntu系統 2 2 構建特徵表 2 2 1 數據導入 2 2 2 去噪 2 2 3 導出特徵表 2 2 4 BIOM文件 2 3 物種註釋 2 3 1 參考資料庫 2 3 2 訓練分類器 2 3 3 物種組成 2 4 小結 第3章 微生物多樣性分析 3 1 PAST軟體 3 2 Alpha多樣性 3 2 1 數據導入 3 2 2 計算多樣性指數 3 2 3 Alpha多樣性指數 3 3 稀釋曲線 3 4 Beta多樣性 3 4 1 數據導入 3 4 2 距離矩陣 3 4 3 UPGMA聚類分析 3 4 4 群落差異檢驗 3 4 5 排序分析 第4章 微生物群落結構及差異分析 4 1 群落結構 4 1 1 百分比堆積柱狀圖 4 1 2 熱圖 4 1 3 韋恩圖 4 1 4 樣本–物種丰度關聯Circos弦裝圖 4 1 5 小結 4 2 差異分析 4 2 1 統計檢驗 4 2 2 LEfSe在線分析 第5章 基因功能預測 5 1 PICRUSt 5 1 1 配置環境 5 1 2 標準分步流程 5 1 3 KEGG通路層級匯總 5 2 Tax4Fun 5 2 1 配置環境 5 2 2 運行分析 5 3 FAPROTAX 5 3 1 配置環境 5 3 2 數據準備 5 3 3 功能預測 5 4 代謝通路丰度柱狀圖 5 4 1 基於PICRUSt2輸出數據繪圖 5 4 2 基於Tax4Fun2輸出數據繪圖 5 4 3 基於FAPROTAX輸出數據繪圖 5 5 STAMP軟體 5 5 1 導入數據 5 5 2 假設檢驗 5 5 3 分析可視化 5 5 4 注意事項 第6章 微生物與環境因子關聯分析 6 1 環境因子分析 6 2 冗餘分析 6 2 1 分析原理 6 2 2 分析步驟 6 2 3 導出圖形 6 3 網路分析 6 3 1 分析原理 6 3 2 Cytoscape 6 3 3 Gephi 6 4 隨機森林模型分析 6 4 1 分析原理 6 4 2 分析內容 參考文獻 詳細資料或其他書籍請至台灣高等教育出版社查詢，查後請於PChome商店街私訊告知ISBN或書號，我們即儘速上架。 |
