農業害蟲病原真菌基因功能研究 張傑 9787518995707 【台灣高等教育出版社】

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原出版社:科學技術文獻
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書名:農業害蟲病原真菌基因功能研究
ISBN:9787518995707
出版社:科學技術文獻
著編譯者:張傑
頁數:262
所在地:中國大陸 *此為代購商品
書號:1637807
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內容簡介

當前,利用昆蟲病原真菌控制農業有害昆蟲,實施生物控制和病蟲害綜合治理(IPM)是造就綠色環境的重要途徑之一。全書共六章,分別介紹農業害蟲病原真菌概況、反向遺傳學研究基礎、基因功能的生物信息學分析、僵菌微管蛋白和MAPPT1蛋白的基因功能研究實例,詳細介紹了反向遺傳學在農業害蟲病原真菌中的應用。

作者簡介

張傑,1975年5月生,河南太康縣人,漢族,博士研究生學歷,生物學專業。現為周口師範學院生命科學與農學學院專職教師,從事昆蟲病原真菌微生物研究。在國內外期刊上微生物領域發表相關論文30多篇。

目錄

第一章 導論
1 1 研究背景
1 2 研究現狀
1 2 1 真菌侵染過程的研究
1 2 2 真菌產生代謝物的研究
1 2 3 侵染后的宿主防禦研究
1 2 4 相互作用的三級程度研究
1 2 5 被侵染的昆蟲致死性行為變化研究
1 2 6 昆蟲病原菌的傳播方式研究
1 2 7 昆蟲宿主-病原菌模型的遺傳多樣性研究現狀
1 2 8 昆蟲病原真菌的流行病學研究
1 2 9 建模
1 2 10 控制潛力
1 2 11 毒力基因與非毒力基因
1 3 研究技術路線
第二章 基因功能的實驗研究過程
2 1 載體結構
2 2 質粒的擴大培養與提取(以天根質粒提取試劑盒為例)
2 3 質粒?切
2 4 回收?切質粒(OMEGA凝膠回收試劑盒)
2 5 目的基因的尋找與電子PCR
2 6 ?切位點分析
2 7 引物設計和接頭添加
2 8 PCR擴增
2 9 上樣電泳
2 10 PCR產物回收
2 11 ?切質粒回收物和PCR純化產物的連接
2 12 感受態大腸桿菌轉化
2 13 陽性克隆鑒定
2 14 靶基因的下游片段重組
2 15 重組完整的質粒電轉到農桿菌
2 16 農桿菌侵染目標真菌
2 17 真菌轉化子培養與PCR驗證
2 17 1 真菌轉化子培養與PCR驗證過程
2 17 2 微量DNA提取試劑配方
2 18 真菌轉化子的Southern Blotting雜交驗證
2 18 1 真菌基因組DNA提取
2 18 2 Southern Blotting雜交操作
第三章 基因功能的生物信息學研究
3 1 Motif的分析與再現
3 1 1 序列下載
3 1 2 Motif分析
3 1 3 Motif分析再現
3 1 4 MEME的應用
3 2 Motif的批量分析方法
3 2 1 文件準備
3 2 2 導入數據與設置
3 2 3 細節調整與文件保存
3 2 4 空間位置大小調節
3 2 5 文本設置
3 2 6 其他
3 3 多基因組比對和共線性分析Mauve軟體
3 4 蛋白質三維結構預測(SWISS-MODEL)
3 5 同源性分析—進化樹構建
3 5 1 Mega軟體構建進化樹
3 5 2 clustalx與Mega聯合構建進化樹
3 5 3 在線比對與Mega聯合構建進化樹
3 5 4 構建系統發育樹需要注意的問題
3 5 5 系統發育樹的美化
3 6 小RNA分析方法
3 6 1 數據下載
3 6 2 mRNA差異表達
3 6 3 lncRNA差異表達
3 6 4 miRNA差異表達
3 6 5 ceRNA網路構建
3 7 基因編碼蛋白的二級結構預測
3 7 1 PSIPRED Workbench在線預測
3 7 2 COILS在線預測捲曲結構
3 7 3 Jpred4在線預測
3 7 4 scratch proteomics在線預測
3 7 5 Predict Protein在線預測
3 7 6 信號?的在線預測
3 8 蛋白質的物理化學性質預測
3 9 基因的模體識別與解析
3 10 蛋白結構的可視化
3 11 基因的富集信號通路分析
3 12 分子對接分析
3 12 1 分子對接的基礎
3 12 2 Chimera軟體分子對接過程
3 12 3 分子對接細節展示
3 12 4 分子對接結果平面化
3 13 蛋白活性口袋的預測
3 14 antiSMASH資料庫—微生物次生代謝物合成基因簇查詢和預測
3 15 蛋白的多級構比對分析
3 16 Circos在線繪圖
第四章 蝗綠僵菌微管蛋白(β-tubulin)基因的功能
4 1 研究背景
4 2 研究的內容
4 3 實驗材料
4 3 1 主要儀器設備
4 3 2 主要試劑和培養基
4 4 實驗方法
4 4 1 菌株和培養條件
4 4 2 生物信息學分析
4 4 3 真菌基因組DNA和RNA提取
4 4 4 熒光染色及觀察
4 4 5 Southern blotting
4 4 6 載體構建及轉化子的獲得
4 4 7 孢子和蟲菌體的計數
4 4 8 產孢量的測定
4 4 9 昆蟲生測
4 4 10 PCR擴增程序和條件
4 4 11 數據處理
4 5 結果分析
4 5 1 蝗綠僵菌β-tubulin基因的生物信息學分析
4 5 2 蝗綠僵菌目標基因β-tubulin基因敲除和回復轉化子的驗證
4 5 3 蝗綠僵菌β-tubulin基因對菌落形態和菌絲形態的影響
4 5 4 蝗綠僵菌β-tubulin基因對毒力的影響
4 5 5 蝗綠僵菌β-tubulin基因對產孢的影響
4 5 6 蝗綠僵菌β-tubulin基因對侵染結構附著胞的影響
4 5 7 蝗綠僵菌β-tubulin基因在細胞核事件中的功能
4 6 討論
第五章 蝗綠僵菌MaPpt1負調控微循環產孢和紫外抗性
5 1 研究背景
5 2 研究內容和技術路線
5 2 1 研究內容
5 2 2 研究技術路線
5 3 實驗材料
5 3 1 主要儀器設備
5 3 2 主要試劑和培養基
5 4 實驗方法
5 4 1 菌株和培養條件
5 4 2 生物信息學分析
5 4 3 真菌基因組DNA和RNA提取
5 4 4 熒光染色及觀察
5 4 5 Southern blotting
5 4 6 載體構建及轉化子的獲得
5 4 7 孢子和蟲菌體的計數
5 4 8 產孢量的測定
5 4 9 昆蟲生測
5 4 10 RNA的提取和定量分析
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