人工智能在生物信息學中的應用 雷秀娟 潘毅 9787030765482 【台灣高等教育出版社】

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書名:人工智能在生物信息學中的應用
ISBN:9787030765482
出版社:科學
著編譯者:雷秀娟 潘毅
頁數:464
所在地:中國大陸 *此為代購商品
書號:1606277
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內容簡介

本書以人工智慧方法和生物組學數據分析為主線,闡述了人工智慧中的群智能優化、機器學習、深度學習等演算法的基本原理,並探討了如何將這些演算法應用於生物信息學相關問題的研究中,如蛋白質複合物挖掘、關鍵蛋白質識別、疾病基因預測、多種組學(轉錄組學、代謝組學、微生物組學)數據與疾病的關聯關係預測、circRNA-RBP結合位點預測、RNA甲基化位點預測以及藥物發現等。本書系統收集整理了生物組學相關資料庫,另結合應用問題,從人工智慧演算法設計到具體流程計算,再到結果分析,均給出了詳細步驟,以上均是本書的特色所在。 本書適合人工智慧、計算機科學、生物信息學、生命科學、生物統計、生物化學以及其他交叉學科專業的高年級本科生及研究生學習,也可供其他理工科專業研究人員、程序開發人員和生物信息計算愛好者參考。

目錄


前言
第1章 緒論
1 1 引言
1 2 人工智慧
1 2 1 人工智慧的發展歷史
1 2 2 人工智慧的發展現狀
1 3 大數據時代下的生物信息學
1 3 1 生物信息學
1 3 2 組學大數據的誕生
1 3 3 組學數據的類型與特點
1 3 4 多組學數據融合研究
1 4 人工智慧在生物信息領域中的應用
1 4 1 人工智慧與生物醫藥
1 4 2 人工智慧在多組學數據分析中的應用
1 5 章節安排
1 6 小結
參考文獻
第2章 生物多組學知識與資料庫介紹
2 1 引言
2 2 組學基礎知識
2 2 1 基因組學
2 2 2 蛋白質組學
2 2 3 轉錄組學
2 2 4 代謝組學
2 2 5 微生物組學
2 2 6 表觀遺傳組學
2 2 7 單細胞組學
2 2 8 時空組學
2 3 生物數據資源
2 3 1 生物信息學常用資料庫
2 3 2 基因數據資源與常用工具
2 3 3 蛋白質數據資源
2 3 4 非編碼RNA資料庫
2 3 5 代謝物數據資源
2 3 6 微生物資料庫
2 3 7 表觀遺傳組學資料庫
2 3 8 單細胞組學資料庫
2 3 9 時空組學資料庫
2 3 10 疾病及疾病靶點資料庫
2 3 11 藥物資料庫
2 4 小結
參考文獻
第3章 生物網路特性與相似性
3 1 引言
3 2 生物網路概述
3 2 1 生物網路的構建
3 2 2 二分網路和異構網路
3 3 生物網路結點的度量方法
3 3 1 中心性度量方法
3 3 2 PageRank演算法
3 4 相似性計算方法
3 4 1 基於拓撲結構的相似性
3 4 2 基於序列的相似性
3 4 3 基於表達數據的相似性
3 4 4 基於語義本體的相似性
3 4 5 基於關聯關係的相似性
3 4 6 基於分子結構的相似性
3 4 7 基於網路傳播的相似性
3 5 小結
參考文獻
第4章 智能優化演算法
4 1 引言
4 2 粒子群優化演算法
4 2 1 粒子群優化演算法仿生原理
4 2 2 基本粒子群優化演算法描述
4 2 3 基本粒子群優化演算法步驟
4 3 人工魚群演算法
4 3 1 人工魚群演算法仿生原理
4 3 2 人工魚群演算法描述
4 3 3 人工魚群演算法步驟
4 4 人工蜂群演算法
4 4 1 人工蜂群演算法仿生原理
4 4 2 人工蜂群演算法描述
4 4 3 人工蜂群演算法步驟
4 5 螢火蟲演算法
4 5 1 螢火蟲演算法仿生原理
4 5 2 螢火蟲演算法描述
4 5 3 螢火蟲演算法步驟
4 6 布谷鳥搜索演算法
4 6 1 布谷鳥搜索演算法仿生原理
4 6 2 布谷鳥搜索演算法描述
4 6 3 布谷鳥搜索演算法步驟
4 7 果蠅優化演算法
4 7 1 果蠅優化演算法仿生原理
4 7 2 果蠅優化演算法描述
4 7 3 果蠅優化演算法步驟
4 8 花授粉演算法
4 8 1 花授粉演算法仿生原理
4 8 2 花授粉演算法描述
4 8 3 花授粉演算法步驟
4 9 鴿群優化演算法
4 9 1 鴿群優化演算法仿生原理
4 9 2 鴿群優化演算法描述
4 9 3 鴿群優化演算法步驟
4 10 小結
參考文獻
第5章 機器學習
5 1 引言
5 2 邏輯回歸
5 2 1 邏輯回歸原理
5 2 2 模型求解
5 3 支持向量機
5 3 1 支持向量機演算法原理
5 3 2 核函數
5 4 決策樹和隨機森林
5 4 1 決策樹
5 4 2 隨機森林
5 5 神經網路
5 5 1 單層神經網路
5 5 2 多層神經網路
5 5 3 激活函數
5 6 基於劃分的聚類演算法
5 6 1 k-Means聚類演算法
5 6 2 k-中心點聚類演算法
5 7 基於密度的聚類演算法
5 7 1 DBSCAN演算法
5 7 2 OPTICS演算法
5 8 基於層次的聚類演算法
5 8 1 BIRCH演算法
5 8 2 變色龍聚類演算法
5 9 馬爾可夫聚類演算法
5 10 評價指標
5 10 1 數值評價指標
5 10 2 圖形評價指標
5 10 3 交叉驗證
5 11 小結
參考文獻
第6章 深度學習
6 1 引言
6 2 卷積神經網路
6 2 1 卷積的概念
6 2 2 卷積神經網路的基本結構
6 2 3 卷積神經網路的求解
6 3 循環神經網路
6 3 1 循環神經網路的基本模型
6 3 2 長短期記憶網路
6 3 3 門控循環單元
6 4 自編碼器
6 4 1 自編碼器原理
6 4 2 深度自編碼器
6 4 3 圖自編碼器
6 5 圖神經網路
6 5 1 圖神經網路原理
6 5 2 圖神經網路分類
6 6 圖卷積網路
6 6 1 圖卷積網路原理
6 6 2 圖卷積網路的理解
6 7 圖注意力網路
6 7 1 注意力機制
6 7 2 圖注意力網路模型
6 8 Word2vec詞嵌入演算法
6 8 1 詞嵌入
6 8 2 連續詞袋模型
6 8 3 跳字模型
6 9 小結
參考文獻
第7章 PPI網路及蛋白質複合物挖掘方法
7 1 引言
7 2 蛋白質複合物
7 2 1 蛋白質複合物作用
7 2 2 蛋白質複合物結構
7 3 基於群智能優化的蛋
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