內容簡介
全書共包括十九個精心設計的實驗,內容涵蓋生物信息學資源和文獻的檢索、Linux系統的使用、生物資料庫的利用和數據的獲取,生物信息學環境的搭建和工具的安裝、Python和R語言的編程基礎及繪圖,序列比對的在線和本地化分析、系統發育分析及可視化、單菌基因組學、核酸和蛋白質序列分析、基因和蛋白的功能註釋、蛋白質結構預測與可視化、16SrRNA擴增子數據分析、短序列讀長和長序列讀長的宏基因組數據分析、轉錄組學、宏病毒組學、單細胞組學和生物網絡構建等。更為重要的是本書編寫的同時為了適應不同的讀者,相應實驗內容又分為Windows和Linux/Unix系統下的實現方式,並配合詳細的步驟說明和大量的示例代碼,可以讓讀者通過實踐操作來加深理解這些內容,更快的實現不同類型數據的分析。作者簡介
韓毛振,博士,安徽醫科大學生命科學學院副教授,先後主持國家自然科學基金青年科學基金項目、安徽省優秀青年基金項目、安徽省省級科學研究項目和省級質量工程項目。研究方向為微生物組學數據的整合挖掘及菌群在健康和環境領域的相關機制和轉化。在Gut、Chem Eng J、JHazard Mater、Gutmicrobes和GPB等期刊發表SCI論文43篇(其中作為第一或通訊作者發表的有27篇),出版專著2部,獲得授權發明專利3項、軟著9項。教授「生物信息學」和「生物信息學實驗課」等課程。指導學生獲批國家級創新創業項目2項、省級創新創業項目1項,獲得國家級競賽二等獎1項,省級B類比賽一等獎2項、二等獎2項、三等獎2項,獲優秀指導教師,安徽醫科大學優秀黨員、優秀班主任等稱號。目錄
實驗一 生物信息網站資源和文獻檢索技術