系統生物學與發酵工程 劉立明 9787518423187 【台灣高等教育出版社】

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書名：系統生物學與發酵工程
ISBN：9787518423187
出版社：中國輕工業
著編譯者：劉立明
頁數：467
所在地：中國大陸 *此為代購商品
書號：1700597
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內容簡介

本書以系統生物學的研究工具、研究對象和發酵工程應用為主線，介紹了系統生物學在發酵工程應用過程中涉及的多尺度組學挖掘、生物網絡模型構建與優化、細胞生理功能解析、代謝調控機制研究等多種關鍵技術，在此基礎上總結了近年來國內外系統生物學在微生物領域中的典型研究進展，從而為相關科研人員提供分析和解決問題的思路和方法。本書共包括九章，第一章對系統生物學的發展及其在發酵工程中的應用進行簡要概述；第二章、第三章全面介紹目前國內外最新的系統生物學資源庫和研究工具、生物網絡的分類、網絡模型的構建與評估技術；第四章至第九章詳細介紹了系統生物學在發酵工程中的應用，涉及維生素C、燃料乙醇、丙酮酸、益生菌、白酒和外源蛋白等多種發酵產品。

目錄

第一章 緒論
第一節 系統生物學的發展概況
一、系統生物學的產生和發展
二、系統生物學的研究內容和方法
三、系統生物學的實踐
第二節 系統生物學在發酵工程中的應用與發展趨勢
一、工業系統生物學與系統代謝工程
二、工業系統生物學的應用
三、工業系統生物學的發展趨勢
參考文獻
第二章 系統生物學資源庫和研究工具
第一節 綜合性組學資料庫
一、美國國家生物技術信息中心
二、歐洲生物信息研究所資料庫
三、日本DNA資料庫
四、中國國家基因庫
第二節 生物途徑網絡資料庫
一、綜合性代謝途徑資料庫
二、轉錄調控途徑資料庫
三、細胞信號通路資料庫
第三節 蛋白質結構與相互作用資料庫
一、蛋白質結構資料庫
二、蛋白與蛋白相互作用資料庫
第四節 生物系統建模和模擬工具
一、系統生物模型標記語言和圖注
二、系統生物網絡模型類型
三、生物網絡模擬編輯工具
四、Cytoscape數據整合及網絡顯示平台軟體
參考文獻
第三章 重要發酵工業微生物的全基因組規模網絡模型的構建與應用
第一節 基因組規模生物網絡概述
一、基於組學大數據構建基因組規模生化模型
二、基因組規模生物網絡模型解析微生物生理特性
三、基於基因組規模生物網絡發展菌種生產性能優化策略
第二節 基因組規模代謝網絡模型
一、基因組規模代謝網絡模型的進展
二、基因組規模代謝網絡模型的構建
三、基因組規模代謝網絡資料庫平台
第三節 基因組規模輔因子網絡模型的構建
一、基因組規模輔因子網絡模型icmNX6434的構建
二、基於模型icmNX6434解析輔因子代謝途徑
三、基於模型icmNX6434解析工業微生物生產發酵特性
第四節 基因組規模轉錄調控網絡模型的構建
一、轉錄調控網絡的數學表述
二、轉錄調控網絡的構建方法
第五節 蛋白質互作網絡模型的構建
一、蛋白質和蛋白質相互作用
二、蛋白質和小分子相互作用
第六節 基因組酶約束互作網絡模型的構建
一、基因組規模酶約束模型研究進展
二、大腸桿菌酶約束模型ec_iML1515的構建
第七節 微生物全細胞模型
一、微生物全細胞模型研究進展
二、釀酒酵母全細胞模型
參考文獻
第四章 系統生物學在維生素C發酵中的應用
第一節 維生素C生產菌株基因組學研究
一、普通生酮基古龍酸菌的全基因組測序和功能基因分析
二、巨大芽孢桿菌的全基因組測序和分析
第二節 K vulgare基因組規模代謝網絡模型的構建與應用
一、K vulgare基因組規模代謝網絡模型的構建和基本特徵
二、基於模型iWZ663對K vulgare的生理性能分析
三、基於模型iWZ663解析K vulgare合成2-酮基-L-古龍酸
第三節 巨大芽孢桿菌基因組規模代謝網絡模型的構建與應用
一、巨大芽孢桿菌基因組規模代謝網絡模型的構建和基本特徵
二、基於模型iMZ1055對巨大芽孢桿菌生理特性的解析
第四節 兩菌代謝互作網絡模型的構建與應用
一、基於已有組學數據對兩菌關係的解析
二、兩菌代謝互作網絡模型iWZ-KV-663-BM-1055的構建
三、基於iWZ-KV-663-BM-1055解析兩菌相互作用
第五節 基於GSMMs優化營養供給提高維生素C生產效率
一、基於GSMMs確定K vulgare的最小合成培養基
二、基於K vulgare生長營養譜優化維生素C生產
三、基於GSMMs評價山梨糖對B megaterium裂解形成芽孢的影響
參考文獻
第五章 系統生物學在燃料乙醇發酵中的應用
第一節 單雙倍體酵母對乙醇耐受性的組學研究
一、單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的轉錄組學分析
二、單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的代謝物組學分析
三、單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的蛋白組學分析
四、單雙倍體酵母細胞對乙醇響應的比較脂組學研究
第二節 釀酒酵母對糠醛和乙酸?響應轉錄組學研究
一、釀酒酵母對糠醛的轉錄組水平響應
二、釀酒酵母耐受菌對糠醛的轉錄組水平響應
三、釀酒酵母對乙酸的轉錄組水平響應
四、釀酒酵母耐受菌對乙酸的轉錄組水平響應
第三節 糠醛和苯酚對釀酒酵母的作用定量蛋白質組學
一、釀酒酵母及糠醛耐受菌株的比較蛋白質組學研究
二、釀酒酵母及苯酚耐受菌株的比較蛋白質組學研究
第四節 乙醇發酵過程中的比較脂組學研究
一、釀酒酵母普通菌株和木糖利用菌在不同培養基中的發酵情況
二、膜上磷脂的變化與酵母菌株乙醇發酵的關係
參考文獻
第六章 系統代謝工程在丙酮酸發酵生產中的應用
第一節 光滑球擬酵母全基因組解析
一、丙酮酸工業菌株光滑球擬酵母全基因組測序
二、光滑球擬酵母基因組規模代謝模型的構建和基本特徵
三、基於全基因組代謝模型解析光滑球擬酵母高產丙酮酸的生產性能
第二節 光滑球擬酵母生產丙酮酸中NA
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