知菌知病-宏基因組精準健康的未來 賈慧玨 9787302675037 【台灣高等教育出版社】

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書名:知菌知病-宏基因組精準健康的未來
ISBN:9787302675037
出版社:清華大學
著編譯者:賈慧玨
頁數:196
所在地:中國大陸 *此為代購商品
書號:1700591
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內容簡介

人體共生微生物已被證實與多種複雜疾病有關,對共生菌群的研究,不僅可以規範個人健康管理,也能為公共衛生政策的制定提供指導。本書主要圍繞人體共生微生物的致病機理,講述從出生到衰老的各個階段,人體各部位(腸道,口腔/呼吸道,皮膚及生殖道)的共生微生物如何隨著環境、飲食、免疫反應等發生改變。書中介紹了微生物中包含了哪些對預測疾病風險有幫助的信息,討論了隨著高通量測序的成熟,微生物關聯分析實驗的設計原則,例如微生態,因果推斷等。每章配有開放性的思考題,用來啟發讀者結合自身領域,思考宏基因組學潛在的應用場景。

目錄

第1章 超有機體——微生物與宿主共生
1 1 溯古追源——新技術帶來的新發現
1 2 人體內有多少微生物細胞?
1 3 人體中的病毒微粒
1 4 其他物種中的微生物組
1 5 來自遠古的微生物組
1 6 總結
第2章 微生物群落生態
2 1 宏觀生態學中的營養級
2 2 微生物群落穩定性、多樣性及豐富度
2 3 皮膚微生物的幾種不同生境
2 4 影響口腔微生物的因素
2 5 一個穩定的腸道菌群
2 6 腸型和塞倫蓋蒂法則
2 7 總結
第3章 宏基因組樣本收集
3 1 樣本中非微生物的部分,會影響DNA提取和測序量
3 2 對於糞便及生物量較低的宏基因組,要注意減少採樣過程中每一步的污染
3 3 採樣后,防止微生物增殖的試劑
3 4 對於宏基因組樣本的DNA提取方法
3 5 測序量
3 6 分類和功能概況,以及絕對丰度
3 7 宏基因組關聯分析的樣本量
3 8 總結
第4章 人體中的流行病學
4 1 和新型冠狀病毒疫情類比
4 2 嬰兒腸道共生菌的來源
4 3 共生微生物的異位存續
4 4 病灶部位菌群
4 5 微生物組中的跨界相互作用
4 6 其他顯示微生物存在差異的組學數據
4 7 總結
第5章 演化中的微生物分類
5 1 對於常規應用的固定參考集
5 2 隨著分類單元精度提升,數據變得稀疏
5 3 物種水平以下的微生物演化歷程
5 4 全細胞模型以實現從基因組到功能的完整預測
5 5 總結
第6章 共生微生物的疾病因果關係
6 1 因果推斷
6 2 人類微生物和疾病之間關係的當前證據等級
6 3 從微生物到分子
6 4 總結
第7章 宏基因組的臨床應用
7 1 疾病篩查領域的宏基因組研究
7 2 臨床實踐啟發深入研究
7 3 利用微生物組知識重新定義現有疾病分類的可能性
7 4 總結
第8章 微生物檔案描繪生命軌跡
8 1 在重要階段進行前瞻性微生物採樣
8 2 從基因風險到疾病預防
8 3 總結
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