中藥網絡藥理學 郭宏偉 9787030801999 【台灣高等教育出版社】

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書名:中藥網絡藥理學
ISBN:9787030801999
出版社:科學
著編譯者:郭宏偉
頁數:238
所在地:中國大陸 *此為代購商品
書號:1697048
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內容簡介

本書專註于中藥網路藥理學的基本概念、研究方法和應用實例,旨在為讀者提供全面的理論和實踐指導。本書共分為五章。第一章為中藥網路藥理學概論,介紹中藥網路藥理學的提出背景、發展過程、研究模式、優勢和挑戰:第二章為中藥網路藥理學分析常用工具,介紹中藥成分分析技術與工具、中藥成分靶點檢索工具、疾病靶點和常用特定疾病相關資料庫、蛋白質相互作用及富集分析資料庫、可視化相關工具及分子對接常用軟體;第三章為中藥網路藥理學分析實踐教程,詳細介紹中藥成分採集、成分靶點檢索、疾病靶點檢索、蛋白質相互作用資料庫、基因功能富集分析、網路可視化及分子對接的實踐流程;第四章為中藥網路藥理學模式研究案例,分別從中藥網路藥理學預測研究和中藥網路藥理學結合實驗驗證兩個方面介紹中藥網路藥理學的研究模式;第五章為中藥網路藥理學應用研究案例,介紹中藥網路藥理學在中藥藥性理論、中藥質量標誌物、中藥安全性評價、中藥新葯研發及中成藥二次開發等方面的應用研究。 本書的讀者對象為中醫藥領域的研究人員、學生及愛好者,致力於幫助他們更好地理解並應用中藥網路藥理學方法,提高他們的研究思路和科研能力。希望本書的出版能夠為中藥的現代化和國際化進程貢獻力量。

目錄

第一章 中藥網路藥理學概論
1 1 中藥網路藥理學的提出與發展
1 1 1 提出背景
1 1 2 發展過程
1 1 3 發展現狀
1 2 中藥網路藥理學研究模式
1 2 1 網路構建
1 2 2 網路可視化
1 2 3 網路分析
1 2 4 網路驗證
1 3 中藥網路藥理學的優勢和挑戰
1 3 1 優勢和應用
1 3 2 面臨的挑戰
1 3 3 發展的方向
參考文獻
第二章 中藥網路藥理學分析常用工具
2 1 中藥成分分析技術與工具
2 1 1 中藥成分採集技術
2 1 2 中藥成分檢索工具
2 2 中藥成分靶點檢索工具
2 2 1 SwissTargetPrediction:生物活性小分子靶點檢索網站
2 2 2 PharmMapper:藥效團模型分子垂釣資料庫
2 2 3 ChemMapper:靶點預測及化學關係研究平台
2 2 4 HIT 2 0:草藥成分靶標平台
2 2 5 Bingding DB:藥物靶點和小分子互作資料庫
2 2 6 SEA:相似集成方法資料庫
2 2 7 TargetNet:藥物-靶標相互作用預測資料庫
2 2 8 ChEMBL:藥物化學資料庫
2 2 9 STITCH:化學品相互作用網路
2 2 10 ZINC虛擬篩選市售化合物資料庫
2 2 11 PDTD:潛在藥物靶標庫
2 2 12 SuperPred:化合物-靶標相互作用資料庫
2 2 13 DGIdb:藥物-基因相互作用資料庫
2 2 14 HERB:中藥高通量實驗和參考指南資料庫
2 2 15 ACNPD:抗腫瘤天然產物資料庫
2 2 16 TCMIO:中藥腫瘤免疫資料庫
2 3 疾病靶點相關資料庫
2 3 1 OMIM:在線孟德爾人類遺傳資料庫
2 3 2 TTD:治療靶標資料庫
2 3 3 DRUGBANK:藥物和藥物靶標資料庫
2 3 4 DisGeNET:疾病綜合信息查詢平台
2 3 5 GeneCards:人類基因綜合資料庫
2 3 6 GEO:基因表達綜合資料庫
2 3 7 MalaCards:人類疾病資料庫
2 3 8 GEPIA2:基於基因表達水平值的互動式分析平台
2 4 常用特定疾病相關資料庫
2 4 1 HAGR:人類衰老基因組資源
2 4 2 ProMENDA:抑鬱症相關蛋白質和代謝物網路資料庫
2 4 3 CTD:比較毒理基因組學資料庫
2 5 常用蛋白質相互作用資料庫
2 5 1 STRING:互作基因/蛋白質檢索工具
2 5 2 BioGRID:交互數據集生物通用存儲庫
2 5 3 IntAct:分子相互作用資料庫
2 6 富集分析資料庫
2 6 1 DAVID:生物信息整合富集分析功能資料庫
2 6 2 Metascape:基因功能分析資料庫
2 6 3 ClueGO:Cytoscape富集分析插件
2 6 4 FunRich:功能富集和網路分析工具
2 6 5 Reactome:生物過程知識庫
2 6 6 GeneMANIA:基因功能分析資料庫
2 7 中藥-成分-靶點-疾病可視化相關工具
2 7 1 Cytoscape
2 7 2 Gephi
2 8 分子對接常用軟體
2 8 1 SYBYL:綜合分子模擬軟體
2 8 2 Schrodinger:分子模擬軟體
2 8 3 AutoDock:開源免費分子模擬軟體
2 8 4 SeeSAR:藥物設計軟體
2 8 5 GOLD:計算大小分子結合模式的分子對接程序
參考文獻
第三章 中藥網路藥理學分析實踐教程
3 1 中藥成分採集實踐流程
3 1 1 資料庫檢索法:以TCMSP資料庫為例
3 1 2 實驗數據定性法:高分辨質譜數據結合資料庫進行成分表徵
3 1 3 GNPS資料庫實踐案例
3 1 4 TCMID資料庫實踐案例
3 1 5 BATMAN-TCM資料庫實踐案例
3 2 中藥成分靶點檢索實踐案例
3 2 1 SwissTargetPrediction實踐案例
3 2 2 PharmMapper實踐案例
3 2 3 ChemMapper實踐案例
3 2 4 SEA實踐案例
3 3 疾病靶點相關資料庫使用實踐流程
3 3 1 OMIM資料庫使用實踐流程
3 3 2 TTD資料庫使用實踐流程
3 3 3 DrugBank資料庫使用實踐流程
3 3 4 DisGeNET資料庫使用實踐流程
3 4 蛋白質相互作用資料庫使用實踐流程
3 4 1 STRING資料庫研究蛋白互作實踐流程
3 4 2 BioGRID資料庫研究蛋白互作實踐流程
3 5 基因功能富集分析實踐流程
3 5 1 GO分析實踐流程
3 5 2 KEGG分析實踐流程
3 5 3 富集分析可視化實踐流程
3 6 基於Cytoscape的網路可視化實踐流程
3 7 分子對接實踐流程
3 7 1 從PDB資料庫中篩選蛋白結構
3 7 2 小分子結構文件的獲取
3 7 3 蛋白質受體結構的轉換
3 7 4 小分子配體結構的轉換
3 7 5 計算網格能量
3 7 6 運行AutoDock
3 7 7 結果可視化
第四章 中藥網路藥理學模式研究案例
4 1 中藥網路藥理學預測研究
4 1 1 中藥網路藥理學結合分子對接預測研究
4 1 2 中藥網路藥理學結合文獻分析研究
4 2 中藥網路藥理學結合實驗驗證
4 2 1 中藥網路藥理學結合分子生物學實驗驗證
4 2 2 中藥網路藥理學結合LC-MS成分分析研究
4 2 3 中藥網路藥理學結合基因轉錄組
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