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書名:枯草芽孢桿菌細胞工廠創制及應用
ISBN:9787030597656
出版社:科學
著編譯者:劉龍 陳堅
叢書名:食品科學前沿研究叢書
頁數:390
所在地:中國大陸 *此為代購商品書號:1514375
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本書從代謝元件、代謝途徑和代謝網路三個層次系統闡述了枯草芽孢桿菌細胞工廠的創製,在此基礎上,舉例介紹了枯草芽孢桿菌細胞工廠在N-乙酰氨基葡萄糖等重要功能食品原料生產中的應用:第1章簡述了枯草芽孢桿菌的特點及其在系統生物學和代謝工程方面已有的進展;然後從代謝元件的挖掘與創新、代謝途徑的設計與重構、代謝網路的組裝與適配等方面論述了如何構建高版本枯草芽孢桿菌細胞工廠;第5~9章詳細介紹了枯草芽孢桿菌細胞工廠在N-乙酰氨基葡萄糖、人乳寡糖、維生素K2、N-乙酰神經氨酸、磷脂酶D和幾丁二糖脫乙酰酶合成中的應用。 本書是迄今為止國內外第一部全面介紹枯草芽孢桿菌細胞工廠的專著,可供發酵工程和合成生物學領域的研究人員參考,也可作為研究生教學參考用書。
目錄
前言
第1章 枯草芽孢桿菌概述
1 1 枯草芽孢桿菌系統生物學研究
1 1 1 多組學分析不同層次調控細胞內代謝流的作用
1 1 2 基因表達調控中的sRNA和反義RNA
1 1 3 翻譯后調控和變構相互作用
1 1 4 中心代謝中的酶-酶相互作用
1 2 枯草芽孢桿菌代謝調控元件與基因組改造工具開發
1 2 1 基因表達調控元件的開發
1 2 2 無誘導表達系統和芽孢桿菌遺傳工具箱
1 2 3 合成RNA工具的開發
1 3 枯草芽孢桿菌代謝工程策略
1 3 1 模塊化途徑工程
1 3 2 限制代謝溢流、降低細胞裂解
1 3 3 高通量篩選
1 3 4 基因組縮減
1 3 5 輔因子工程引導的代謝優化
1 3 6 轉運工程策略
1 4 枯草芽孢桿菌底盤細胞改造與構建
1 4 1 枯草芽孢桿菌底盤細胞的研究進展
1 4 2 枯草芽孢桿菌底盤細胞的應用
參考文獻
第2章 枯草芽孢桿菌代謝元件的挖掘與創新
2 1 枯草芽孢桿菌CRISPR工具箱
2 1 1 CRISPR-Cas系統及其在基因編輯和表達調控中的應用
2 1 2 基於CRISPR-Cpf1的枯草芽孢桿菌多基因編輯系統
2 1 3 基於CRISPR-Cpf1的枯草芽孢桿菌多基因表達調控系統
2 2 基於凝血酶-核酸適配體的代謝調控元件
2 2 1 體外結構轉換型熒光生物感測器的構建與功能驗證
2 2 2 基於DNA適配體的動態上調元件的設計、優化及應用
2 2 3 基於RNA適配體的動態下調元件的設計、優化及應用
參考文獻
第3章 枯草芽孢桿菌代謝途徑的設計與重構
3 1 基於穩態反應動力學模型的代謝途徑瓶頸診斷
3 1 1 GlcNAc合成途徑動力學模擬
3 1 2 潛在限速步驟存在時GlcNAc合成起始階段動力學模擬
3 1 3 GlcNAc合成起始階段的動力學測定
3 1 4 GlcNAc合成途徑潛在限速步驟的分析及鑒定
3 1 5 阻斷GlcNAc-6-P與GlcNAc之間無效循環對細胞生長和GlcNAc合成的影響
3 1 6 小結
3 2 基於氧化還原力平衡的代謝途徑設計優化
3 2 1 輔因子工程
3 2 2 輔因子工程策略
3 3 基於非天然氨基酸的細胞生長與代謝途徑調控
3 3 1 枯草芽孢桿菌中非天然氨基酸系統
3 3 2 非天然氨基酸系統用於細胞生長與代謝途徑調控
3 3 3 非天然氨基酸系統用於生物封存
3 3 4 小結
3 4 基於功能膜微域的代謝途徑區室組裝
3 4 1 細菌中的功能膜微域
3 4 2 FMM在質膜上的分佈及動力學行為
3 4 3 腳手架蛋白FloA和FloT的相關性分析
3 4 4 FMM-多酶複合體系統的設計和構建
3 4 5 動力學模型和代謝物動力學表徵底物通道
3 4 6 FloT和SPFH結構域過表達對細胞生長的影響
3 4 7 FMM-多酶複合體與酶表達的相關性分析
3 4 8 工程菌的理化性質改造和活細胞檢測
3 4 9 FMM改造對細胞生長的影響
3 4 10 基於FMM組分修飾的途徑酶組裝
參考文獻
第4章 枯草芽孢桿菌代謝網路的組裝與適配
4 1 基於基因迴路的代謝網路自動全局調控
4 1 1 枯草芽孢桿菌中可編程生物感測器耦合CRISPRi基因迴路
4 1 2 基於雙功能丙酮酸響應基因迴路的B subtilis中心代謝全局控制
4 2 基於細胞群體感應的代謝網路系統
4 2 1 枯草芽孢桿菌群體感應系統概述
4 2 2 組氨酸激酶KinA改造對芽孢產生的影響
4 2 3 構建Spo0A-P調控啟動子表達水平文庫
4 2 4 受Spo0A-P激活調控啟動子的構建
4 2 5 受Spo0A-P阻遏調控啟動子的構建
4 2 6 Phr60-Rap60對Spo0A-P調控能力的影響
4 3 基於多模型驅動的代謝網路智能化調控
4 3 1 GSMM搭建及應用
4 3 2 基於GSMM驅動的代謝網路智能化調控
4 3 3 基於TRNM驅動的代謝網路智能化調控
4 3 4 基於多約束模型驅動的代謝網路智能化調控
4 3 5 展望
4 3 6 小結
參考文獻
第5章 枯草芽孢桿菌細胞工廠合成瓜乙酰氨基葡萄糖
5 1 中心碳代謝優化促進GlcNAc合成
5 1 1 阻斷副產物乙偶姻溢流對GlcNAc合成的影響
5 1 2 阻斷乙偶姻合成導致副產物乙酸溢流
5 1 3 添加碳酸鈣和恆pH補料分批發酵對GlcNAc合成的影響
5 1 4 阻斷副產物乙酸溢流對GlcNAc合成的影響
5 2 關鍵酶強化改變碳代謝流分佈促進GlcNAc合成
5 2 1 N端融合標籤提高關鍵酶CeGNA1表達
5 2 2 RBS優化對GlcNAc合成及關鍵酶CeGNA1表達的影響
5 2 3 整合表達關鍵酶EcGlmS促進碳代謝通量流向GlcNAc合成途徑
5 2 4 關鍵酶EcGlmS5,端融合mRNA穩定子對GlcNAc發酵的影響
5 3 途徑酶優化促進GlcNAc合成
5 3 1 丙酮酸積累對胞外pH和胞內pH穩態的影響
5 3 2 關鍵酶CeGNA1定向進化對GlcNAc合成的影響
5 3 3 脲酶表達對胞內pH及GlcNAc合成的影響
5 4 中心氮優化促進GlcNAc合成
5 4 1 阻斷谷氨酸胞內降解途徑對GlcNAc發酵的影響
5 4 2 異源表
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